Britų bendrovė „Oxford Nanopore“ sukūrė USB kaupiklio dydžio įrenginį, kuris suteiks visiems norintiems spartaus jų DNR tyrimo galimybę.
Tai mažiausias DNR sekos nustatymo (sekvenavimo) prietaisas rinkoje, gebantis realiuoju laiku iš pateikto kraujo ar seilių mėginio nuskaityti žmogaus genomo bitus, skelbia „SlashGear.com“. Šis vienkartinio naudojimo įrenginys kainuos mažiau nei 900 JAV dolerių ir rinkai bus pateiktas antrąjį šių metų pusmetį, sakoma pranešime.
Šio prietaiso svarbą sunku pervertinti: jis taps mobilia DNR tyrimų laboratorija, kuri, prijungta prie asmeninio kompiuterio, per trumpą laiką gali nustatyti, ar, pavyzdžiui, biopsijos mėginyje yra vėžio požymių, arba išsiaiškinti, ar archeologinių kasinėjimų metu aptikti kaulų fragmentai yra genetiškai identiški.
„MinION“ pavadintas įrenginys DNR tirti naudoja vadinamųjų nanoporų technologiją. Nanoporos pasižymi savybe praleisti tik tam tikro tipo molekules. Tyrimo metu DNR molekulės „spaudžiamos“ per nanoporas polimerinėje membranoje, o speciali mikroschema fiksuoja tuo metu atsirandančius elektrinius virpesius ir dideliu tikslumu identifikuoja nukleotidų molekules.
Pasak šią technologiją plėtojančių Oksfordo universiteto mokslininkų, medžiagų tyrimas naudojant nanoporas yra labai perspektyvi mokslinių tyrimų kryptis, suteikianti galimybę per kelias minutes atlikti sudėtingiausias analizes, kurioms anksčiau prireikdavo savaičių. Nanoporos yra itin mažos ertmės įvairiose membranose, pavyzdžiui, baltymų sluoksniuose, silicio nitride, grafene ir kt. „Oxford Nanopore“ pasitelkė hibridinę poringo baltymo ir sintetinių medžiagų nanotechnologiją.
Kitais metais „MinION“ kūrėjai planuoja pagaminti dar galingesnį šio įrenginio variantą, kuris naudos 8000 nanoporų (dabartinis turi 2000). Pasak gamintojų, „MinION“ įrenginius bus galima sujungti į tinklą ir greitai atlikti DNR šifravimą. Mokslininkų teigimu, 20 „MinION“ analizatorių žmogaus genomą iššifruoptų per maždaug 15 minučių.
„MinION“ galima naudoti ir tiriant sudėtingų junginių sudėtį, ieškoti mėginiuose įvairių biologinių ir nebiologinių molekulių.
Kompaktiški ir palyginti nebrangūs DNR sekvenavimo įrenginiai suteiks galimybę mokslininkams, medikams, teismo ekspertams atlikti tokius tyrimus ir analizes, kurie anksčiau buvo įmanomi tik didelėse laboratorijose.
Šiame vaizdo siužete plačiau pasakojama apie nanoporų naudojimą sekvenuojant DNR.
Nanopore DNA sequencing from Oxford Nanopore on Vimeo.