Lietuvos mokslo taryba (LMT) kreipėsi į LR Švietimo ir mokslo ministeriją prašydama išaiškinti mokslo ir studijų įstatymo 93 straipsnio 6 dalies baigiamosios nuostatos taikymo ribas. Ši nuostata 2010 m. gali sukelti doktorantūros proceso nesklandumų, prognozuoja taryba ir akademinė bendruomenė.
Minėtoje nuostatoje sakoma, kad universitetai teisę vykdyti doktorantūrą kartu su valstybės mokslo institutais ar universiteto mokslo institutais turi iki 2010 m. sausio 1 d. Todėl kyla pagrįstas klausimas, kaip dabartiniai tarpinstitucinių programų doktorantai turėtų tęsti studijas pasibaigus 2009-iesiems, sakoma LMT pranešime
Pagal Švietimo ir mokslo ministerijos atsakyme pateiktą nuomonę, esamiems doktorantams turi būti sudarytos sąlygos baigti doktorantūrą ta tvarka, pagal kurią jie buvo priimti.
LMT pirmininko prof. Eugenijaus Butkaus teigimu, tokia tvarka padės išlaikyti tęstinumą ir pereinant prie naujųjų Doktorantūros nuostatų. Naujų Doktorantūros nuostatų projektą LR Švietimo ir mokslo ministerijai taryba numačiusi pateikti gruodžio mėnesį.
Pasak E. Butkaus, naujieji Doktorantūros nuostatai turėtų būti taikomi tik naujai priimamiems doktorantams. Disertacijų gynimui eksternu senųjų nuostatų tvarka turėtų būti taikoma dar du metus po naujųjų įsigaliojimo.
Tarybos teigimu, šiam senųjų ir naujųjų doktorantūros nuostatų perimamumui pritaria ir akademinė bendruomenė. Šie principai turėtų būti išdėstyti LR Vyriausybės nutarime, kuriuo bus tvirtinami naujieji nuostatai, teigiama LMT pranešime.