Valstybės kontrolė (VK) priekaištauja Policijos departamentui dėl aplaidaus ir neatsakingo valstybės biudžeto lėšų naudojimo, Viešųjų pirkimų įstatymo pažeidimų, dėl kurių valstybei galėjo būti padaryta milijoninė žala. Siekdama apginti viešąjį interesą, visą audito medžiagą dėl Anykščių rajono policijos komisariato pastato rekonstrukcijos VK perdavė Generalinei prokuratūrai.
Pasak valstybės kontrolierės Rasos Budbergytės, sudarydamas sutartį dėl Anykščių rajono policijos komisariato pastato rekonstrukcijos Lietuvos policijos logistikos centras sudarė galimybę keisti sutarties sąlygas, o tai prieštarauja Viešųjų pirkimų įstatymui. Naudojantis šia galimybe į sutartį įtraukti papildomi darbai, padidinę projekto kainą nuo 12,2 mln. Lt net iki 20,8 mln. Lt. Iki pakeičiant sutartį rangovas buvo atlikęs darbų tik už 1,3 mln. Lt. Pakeitus sutartį buvo patvirtinti ir nauji statybos darbų įkainiai, pradinėje sutartyje numatytų darbų kainą padidinę daugiau nei 4 mln. Lt. Be to, į darbų sąmatą buvo įtraukti 346 tūkst. Lt vertės darbai ir įranga, pirkti netaikant Viešųjų pirkimų įstatymo. Juo nesivadovauta ir įsigyjant komisariato pastato rekonstrukcijos projektą už daugiau nei 88 tūkst. Lt.
Iš viso už 2008 m. atliktus darbus Logistikos centras permokėjo 231 tūkst. Lt. Valstybiniams auditoriams patikrinus, ar atlikti visi Anykščių rajono policijos komisariato pastato rekonstrukcijos darbai, kuriuos Logistikos centras jau buvo apmokėjęs, paaiškėjo, kad jų neatlikta daugiau nei už 711 tūkst. Lt.
Audito metu nustatyta, kad valstybės turtas neefektyviai valdomas Vilniaus miesto vyriausiajame policijos komisariate: nesilaikydamas teisės aktų reikalavimų komisariatas žirginio sporto klubui "Aliūras" yra suteikęs teisę nemokamai naudotis administraciniu pastatu, hipodromu ir sandėliu, o Lietuvos olimpiniam sporto centrui - administraciniu pastatu ir hipodromu, esančiais Vilniuje, Belmonte. Su šio turto naudotojais nesudarytos patalpų naudojimo sutartys, nemokama už sunaudotą elektrą, vandenį, šildymo paslaugas.
Viešųjų pirkimų įstatymo pažeidimai nustatyti Lietuvos policijos mokymo centre, kuris daugiau nei už 253 tūkst. Lt be konkurso samdė lektorius mokymams. Į šio centro buhalterinę apskaitą neįtrauktas ir Centrui priklausantis 208,9 tūkst. Lt vertės dalininko įnašas VšĮ Trakų nacionalinio sporto ir sveikatingumo centras.
Buhalterinės apskaitos spragų nustatyta ir kitose Policijos departamentui pavaldžiose įstaigose: Kauno apskrities vyriausiasis policijos komisariatas netinkamai apskaitė pajamas už suteiktas paslaugas ir 367 tūkst. Lt vertės ilgalaikį turtą. Be to, komisariato finansinėse ataskaitose nurodytos daugiau nei 105 mln. Lt darbo užmokesčio, socialinio draudimo įmokų ir kitos išlaidos neatitiko apskaitos duomenų, todėl auditoriai negalėjo įvertinti jų teisingumo. Vilniaus apskrities vyriausiajame policijos komisariate auditoriai negalėjo įvertinti, ar daugiau nei 1,7 mln. Lt darbo užmokesčio lėšų apskaitytos teisingai, o Lietuvos kriminalinės policijos biure buvo neteisingai apskaitomi avansai ir kompiuterinių programų įsigijimo išlaidos.