Valstybės kontrolė įvertino informacinių sistemų būklę valstybiniame sektoriuje 2006 m. Informacinių sistemų valdymas valstybės institucijose nagrinėtas elektroninės valdžios kūrimo kontekste, sakoma Valstybės kontrolės pranešime.
Auditorių vertinimu, kai kurios elektroninės valdžios koncepcijos nuostatos yra pasenusios ir nebeatitinka tikrovės.
Dalis elektroninės valdžios įgyvendinimo priemonių dubliuojasi tarpusavyje, jų vykdymą prižiūri skirtingos institucijos, neretai numatomi skirtingi įgyvendinimo terminai. Pavyzdžiui, Lietuvos informacinės visuomenės plėtros programoje numatyta jau 2007 m. pabaigoje teikti elektroninio parašo paslaugų sertifikavimą, tuo tarpu Viešojo administravimo plėtros strategijos įgyvendinimo priemonių plane šių paslaugų teikimas numatytas 2008 m. pabaigoje. Be to, elektroninio parašo priemonių įdiegimo terminas buvo nukeltas kelis kartus.
Valstybiniai auditoriai nustatė, kad 2006 m. Vyriausybės Informacinių ir žinių visuomenės plėtros komisija, kuriai pavesta spręsti strateginius informacinės visuomenės plėtros klausimus, tinkamai nevykdė dalies savo esminių funkcijų. Todėl, auditorių vertinimu, nebuvo panaudotos visos elektroninės valdžios įgyvendinimo kontrolės galimybės. Auditoriai 2007 m. pastebėjo komisijos veiklos pažangą šioje srityje.
Auditorių teigimu valstybės informacinių sistemų duomenų sauga nėra pakankama - 25 proc. audituotų valstybės įstaigų, valdančių valstybės informacines sistemas, ne visada laikėsi informacinių sistemų duomenų saugumą reglamentuojančių teisės aktų. Todėl yra rizika, kad valstybės informacinėse sistemose neužtikrinamas tinkamas duomenų saugumo lygis.
Pasaulio banko lėšomis buvo finansuotas elektroninės sveikatos informacinės sistemos kūrimo projektas. Nuo 2006 m. kovo mėnesio, uždarius Pasaulio banko atstovybę Lietuvoje, nė vienai šalies institucijai nėra priskirta Pasaulio banko lėšomis finansuojamų informacinių technologijų projektų stebėsenos funkcija. Auditorių nuomone, Vyriausybė turėtų paskirti instituciją, kuri stebėtų Pasaulio banko ir kitų fondų lėšomis finansuojamų informacinių technologijų projektų įgyvendinimą.
Valstybinai auditoriai atsakingoms institucijoms pateikė konkrečias rekomendacijas, kaip būtų galima spręsti valstybinio audito metu nustatytus elektroninės valdžios plėtros trūkumus, sakoma pranešime.
