Seimo Pirmininko pavaduotojui Alfredui Pekeliūnui iškilo abejonių dėl to, ar Konstitucijos nuostatos dėl Seimo ir Prezidento dalyvavimo skiriant į pareigas Valstybės saugumo departamento vadovą ir tai, kad Vyriausybė garantuoja valstybės saugumą, nesukuria teisinės kolizijos, kurios institucijos turi dalyvauti Valstybės saugumo departamento teisinės priklausomybės nustatyme.
„Jei Konstitucija nustato, kad viena iš Vyriausybės funkcijų yra valstybės saugumo garantavimas, kyla klausimas, ar tai nesukuria teisinio reikalavimo, kad Valstybės saugumo departamento steigėjas būtų Vyriausybė, o ne Seimas“, - penktadienį išplatintame pranešime cituojamas A. Pekeliūnas. „Juo labiau, kad 1990 metais Vyriausybės nutarimu įsteigtas Valstybės saugumo departamentas veikė prie Vyriausybės ir tokia sistema egzistavo iki pat 1994 metų.“
Todėl Seimo vicepirmininkas kreipėsi į Seimo Konstitucijos komisiją, kad ši pateiktų argumentuotą nuomonę, ar 1994 metais Seimas, įsteigdamas Valstybės saugumo departamentą savo nutarimu, priėmė teisėtą sprendimą, o galbūt tai buvo kurios nors politinės jėgos valios išreiškimas, sakoma pranešime.