Žemdirbiai už neregistruotus informacinėje duomenų bazėje gyvulius negaus tiesioginių išmokų. Pagal Veterinarijos įstatymą gyvulių laikytojai patys privalo atlikti laikomų gyvulių apskaitą, ženklinti ir informuoti apie paskerdimus.
Valstybinės maisto ir veterinarijos tarnybos duomenimis, šiuo metu gyvulių laikytojai masiškai vėluoja ar net visiškai neteikia informacijos apie įsigytus, parduotus, paskerstus ar naujai atvestus gyvulius. Tokiais atvejais šie gyvuliai nepatenka į sąrašus, už kuriuos valstybė gyvulių laikytojams skiria išmokas.
Valstybinė maisto ir veterinarijos tarnyba yra atsakinga už gyvulių laikymo vietų kontrolę užkrečiamųjų gyvulių ligų prevencijos ir kontrolės atžvilgiu. Kita vertus, ji visiškai neatsako už gyvulių laikytojų kontrolę, kad šie gautų valstybės skiriamas išmokas.
Todėl daugelis nesilaikančių nustatytos tvarkos gyvulių laikytojų gauna valstybės skiriamas išmokas ir reikalauja išmokų net ir už tuos gyvulius, kurie neteisingai ar visiškai nėra registruoti gyvulių registro duomenų bazėje.
Per 2002 metus VMVT patikrino 13215 gyvulių laikymo vietų, iš jų 173 skerdyklas, 41 turgavietę. Per šiuos patikrinimus rasta 1117 gyvulių apskaitos žurnalo pildymo, 1178 gyvulių ženklinimo ir 833 informacijos teikimo pažeidimų.
VMVT, siekdama pašalinti šiuo metu egzistuojančius gyvulių identifikavimo sistemos trūkumus, stengiasi pagal PHARE projektą sukurti ES reikalavimus atitinkančią apskaitos sistemą. Tokia kompleksinė gyvulių registro duomenų bazė leis įdiegti galvijų pasus, taip pat išplėsti registruojamos informacijos srautus.
ELTA